|
|
شنبه ۳۰ فروردين ۱۳۹۳ ساعت ۱۳:۰۲
کد مطلب : 9199
شناسايي چندشكلي اگزون ششم ژن Pit1 در مرغ بومي آذربايجان غربي با استفاده از روش PCR-SSCP
|
جواد برومند، علي هاشمي، كريم مرداني، محمد قادرزاده
ژنهاي بخش سوماتوتروپيك شامل عوامل رونويسي هستند كه در تكامل و رشد جوجه نقش اساسي دارند. ژن Pit1 عامل ويژه رونويسي هيپوفيزي است كه نقش عمدهاي در تمايز هيپوفيز قدامي و تنظيم ژنهاي هورمونهاي پرولاكتين، رشد و محرك تيروئيدي دارد. ژن Pit1 به عنوان يك ژن كانديداي كليدي براي صفات توليدي طيور مورد توجه قرار گرفته است. اين پژوهش به منظور بررسي چندشكلي اگزون ششم ژن Pit1 با استفاده از روش چندشكلي فضايي رشتههاي منفرد مبتني بر واكنش زنجيرهاي پليمراز در مرغ بومي آذربايجان غربي صورت گرفت. در اين طرح از 100 پرنده به صورت تصادفي خون گيري شده و DNA نمونههاي خون استخراج گرديد. براي تعيين كيفيت DNA از ژل آگارز يك درصد استفاده شد. ناحيه اگزون ششم جايگاه Pit1 به طول bp 179 با استفاده از واكنش زنجيرهاي پلي مراز تكثير و محصولات PCR توسط روش SSCP آناليز شدند. محصولات PCR توسط الكتروفورز با ژل پلي آكريلاميد 10 درصد و رنگ آميزي نيترات نقره آشكار گرديد. نتايج SSCP محصولات PCR با ژل پليآكريل آميد سه ژنوتيپ AA، AB و BB را آشكار ساخت. ژنوتيپهاي اين جايگاه ژني انحراف از تعادل هاردي - واينبرگ را نشان دادند. شاخص شانون، شاخص Nie و هتروزيگوسيتي مشاهده شده به ترتيب 59/0، 67/1 و 32/0 به دست آمد. نتايج به دست آمده نشان داد كه نشانگر Pit1 داراي چندشكلي نسبتاً بالايي است و مي تواند در برنامههاي اصلاح نژادي آينده مورد توجه قرار گيرد.
کليدواژگان: چندشكلي، مرغ بومي آذربايجان غربي، PCR، SSCP
